《代謝途徑設計：實驗指南》共分為三篇，圍繞代謝途徑建模、代謝途徑開發、代謝途徑設計展開，主要內容涉及如何用工程生物學的思路，在底盤細胞中對代謝途徑進行挖掘和設計。附錄部分還提供了生物設計工具箱，方便讀者使用。與偏重生物化學途徑的介紹類書籍不同，《代謝途徑設計：實驗指南》的工程生物學特色鮮明，較為系統地介紹了數學模型、計算機工具在代謝途徑設計中的應用。
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