二穗短柄草中抗病基因家族的分析及機(jī)器學(xué)習(xí)預(yù)測方法研究
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本文詳細(xì)分析了模式植物二穗短柄草中抗病基因家族NBS-LRR的特征, 研究了怎樣從其全基因序列中鑒定抗病基因家族及各基因家族內(nèi)成員的特征, 并詳細(xì)分析了這些抗病基因亞類型、結(jié)構(gòu)域、進(jìn)化信息、染色體定位等眾多序列特征, 然后根據(jù)這些序列特征, 研究了從這些抗病基因序列中抽取離散特征向量的方法, 并應(yīng)用不同的機(jī)器學(xué)習(xí)方法對NBS-LRR抗病基因家族進(jìn)行模型構(gòu)建, 并選擇支持向量機(jī)作為一種機(jī)器學(xué)習(xí)模型進(jìn)行模型參數(shù)選擇和參數(shù)優(yōu)化方法, 最后研究了應(yīng)用構(gòu)建好的預(yù)測模型對其它經(jīng)濟(jì)作物全基因組序列進(jìn)行抗病基因的預(yù)測、抗病基因的注釋和分類的一站式分析平臺的構(gòu)建方法。