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本書針對微生物-礦物相互作用，兼顧其微觀作用過程和宏觀效應，介紹其作用原理、研究策略與技術、表征及分子模擬。主要方法和技術包括基于同步輻射的高分辨率光譜學和顯微化學成像等（原位）分析技術、基于實驗室的常規光譜學和顯微鏡檢等表面分析技術、DFT計算及比較蛋白質組學/基因組學技術。主要內容涉及礦物/微生物表面微結構與化學形態演化、微生物群落結構與功能演替、硫化礦物選擇性生物吸附分子模擬、微生物吸附行為、生物膜形成與演化、EPS組成與性質、硫代謝相關蛋白質篩選與功能分析。