核酸納米技術
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叢 書 名:軟物質前沿科學叢書國家出版基金項目
核酸納米技術是一種多學科交叉的研究領域,主要利用核酸分子(DNA 和RNA)尺寸為納米級別、剛性結構、編碼性強的特點來構造各種納米結構,應用于生物醫學、化學、材料等領域。《核酸納米技術》著重介紹核酸納米技術中為引人注目的幾個主要方向,即核酸納米結構組裝、核酸傳感與檢測、核酸納米操縱、核酸納米結構應用以及DNA 分子機器與計算機。
目錄篇 核酸納米技術基礎第1章 核酸納米技術的基本概念 31.1 納米技術引論 31.1.1 納米科技發展簡史 51.1.2 納米領域的眼睛和手 61.1.3 納米領域的磚瓦 7參考文獻 131.2 DNA分子的化學與生物學 151.2.1 DNA的微觀結構 161.2.2 DNA的分子操作 19參考文獻 231.3 結構DNA納米技術簡史 271.3.1 納米尺度下分子自組裝的研究意義 271.3.2 DNA作為納米建筑材料的背景 281.3.3 基于DNA納米磚片的自組裝 291.3.4 DNA折紙術 361.3.5 基于DNA折紙結構的層級自組裝形成的超大結構 411.3.6 總結與展望 43參考文獻 43第2章 核酸納米技術的工具與策略 472.1 DNA分子的成像和納米操縱 472.1.1 單個DNA分子及其復合物的成像 472.1.2 單分子納米操縱 53參考文獻 592.2 自組裝DNA納米結構的構建策略 602.2.1 基于DNA自組裝的納米結構 602.2.2 DNA納米排布 652.2.3 DNA納米機器人 672.2.4 DNA構造納米圖形展望 68參考文獻 702.3 RNA納米技術 762.3.1 RNA的構筑基元與自組裝:RNA建筑學 772.3.2 單鏈RNA的折疊:RNA折紙術 792.3.3 RNA-DNA協同共組裝:優勢互補 822.3.4 RNA納米技術的應用:從結構到功能 83參考文獻 842.4 框架核酸的概念和發展 862.4.1 簡介 862.4.2 框架核酸的概念 862.4.3 框架核酸的設計:DNA折紙術及其軟件 892.4.4 框架核酸對納米級研究對象的空間調控 912.4.5 框架核酸的生物應用 932.4.6 總結和前景 97參考文獻 98第3章 核酸納米技術的應用 1063.1 可以感知的DNA納米技術DNA生物傳感器與基因芯片 1063.1.1 DNA生物傳感器 1063.1.2 DNA芯片 1103.1.3 微流控芯片 111參考文獻 1153.2 可以計算的DNA納米技術DNA邏輯門與DNA計算 1163.2.1 分子邏輯門 1163.2.2 DNA邏輯門 1173.2.3 DNA計算 1213.2.4 總結與展望 125參考文獻 1253.3 可以運動的DNA納米技術DNA分子機器 1273.3.1 鏈置換反應驅動的DNA馬達 1273.3.2 環境因素驅動的DNA馬達 1333.3.3 兩類驅動方式的評價 138參考文獻 139第二篇 核酸納米技術進階第4章 核酸納米結構自組裝 1434.1 結構DNA納米技術研究進展 1434.1.1 二維DNA結構 1444.1.2 三維DNA結構 1464.1.3 DNA自組裝引導的納米粒子二維結構 1514.1.4 DNA自組裝引導的納米粒子三維結構 1544.1.5 DNA自組裝與微加工技術 1564.1.6 挑戰與展望 157參考文獻 1574.2 DNA納米自組裝化學 1614.2.1 DNA模塊自組裝 1634.2.2 無機納米結構的DNA導向組裝 1734.2.3 展望 191參考文獻 1924.3 使用少DNA鏈構建DNA納米結構的策略 2024.3.1 序列對稱性 2034.3.2 通過一條DNA鏈構建DNA納米結構 2044.3.3 結構對稱性 2074.3.4 對稱性DNA納米結構在生物醫學中的應用 2084.3.5 總結與展望 209參考文獻 2104.4 DNA-表面活性劑雜化納米結構材料:自組裝性質及應用 2134.4.1 DNA-表面活性劑和DNA-脂質復合物溶致液晶 2144.4.2 DNA-表面活性劑復合物熱致液晶 2174.4.3 DNA-表面活性劑復合物膜材料 2184.4.4 DNA-表面活性劑復合物的應用 2194.4.5 展望 221參考文獻 2224.5 DNA編碼的化學材料合成技術 2264.5.1 DNA序列編碼的高分子合成 2264.5.2 以DNA納米結構為模板的高分子納米材料合成及其功能 2304.5.3 以DNA納米結構為模板的無機納米顆粒合成 2384.5.4 總結與展望 245參考文獻 2454.6 DNA引導的納米粒子超晶格的組裝 2514.6.1 基于DNA-球形金納米粒子的超晶格 2514.6.2 非典型無機納米粒子的三維有序組裝 2554.6.3 異質二元DNA-NP體系共結晶 2564.6.4 動態超晶格 2584.6.5 基于DNA-NP的多面體微晶 2604.6.6復雜的超晶格 2614.6.7 DNA折紙結構引導納米粒子組裝 2614.6.8 展望 263參考文獻 264第5章 核酸傳感與檢測 2675.1 核酸生物傳感器研究進展 2675.1.1 前言 2675.1.2 傳感方法 2695.1.3 總結與展望 290參考文獻 2915.2 基于水溶性共軛聚合物的核酸分子檢測 3045.2.1 水溶性共軛聚合物結構和性質 3055.2.2 水溶性共軛聚合物的光學特性和傳感機制 3065.2.3 基于共軛聚合物的核酸生物傳感器 3085.2.4 總結與展望 320參考文獻 3205.3 核酸分子線路催化發夾結構自組裝及其分析應用 3255.3.1 CHA的原理和改良 3265.3.2 高溫CHA和全溫區CHA 3305.3.3 CHA的傳導 3325.3.4 CHA與超靈敏分析 3335.3.5 總結與展望 336參考文獻 3365.4 基于細胞篩選的核酸適配體技術在癌癥診斷和治療中的應用 3395.4.1 以活細胞為靶標的核酸適配體篩選技術 3405.4.2 核酸適配體用于癌細胞的檢測 3425.4.3 基于核酸適配體的癌癥標志物發現 3465.4.4 核酸適配體用于癌癥的靶向診療 3485.4.5 總結與展望 354參考文獻 3555.5 核酸適配體和核酶生物傳感器 3605.5.1 核酸適配體和核酶 3605.5.2 核酸適配體生物傳感器 3635.5.3 核酶生物傳感器 3715.5.4 總結與展望 377參考文獻 378第6章 核酸納米操縱 3826.1 DNA分子手術 3826.1.1 DNA分子手術的基本工具及前期技術背景 3826.1.2 DNA分子手術臺和手術刀 3836.1.3 DNA分子手術的若干基本操作 3846.1.4 DNA分子手術的后處理技術 3866.1.5 DNA分子手術當前面臨的主要問題 3876.1.6 展望 388參考文獻 3886.2 DNA的單分子力學 3896.2.1 單分子力學實驗技術 3906.2.2 雙鏈DNA的單分子力學 3926.2.3 單鏈DNA的單分子力學 3996.2.4 雙鏈DNA與單鏈DNA之間的轉變及其力譜特征 4036.2.5 小結 407參考文獻 407第7章 核酸納米結構應用 4117.1 DNA納米技術與生物成像 4117.1.1 生物大分子功能機制的研究 4117.1.2 細胞水平的組織功能的研究 4167.1.3 動物水平的生物成像應用 4187.1.4 DNA納米技術和熒光超分辨成像 4207.1.5 總結與展望 423參考文獻 4247.2 DNA水凝膠:從合成到應用 4277.2.1 前言 4277.2.2 DNA水凝膠的合成策略 4287.2.3 DNA水凝膠的刺激響應 4317.2.4 復合雜化DNA水凝膠 4407.2.5 DNA水凝膠的應用 4437.2.6 存在的問題和展望 454參考文獻 4557.3 DNA納米技術與藥物遞送 4597.3.1 DNA納米技術 4607.3.2 DNA納米結構進入細胞的方式 4657.3.3 DNA納米結構在細胞中的去路 4677.3.4 DNA納米結構作為藥物遞送載體的具體應用 4697.3.5 DNA納米結構可能引起機體的免疫反應 4847.3.6 結語 485參考文獻 4867.4 DNA納米技術遞送小分子化療藥物 4967.4.1 前言 4967.4.2 藥物共價修飾型DNA納米遞送體系 4977.4.3 藥物嵌入型DNA納米遞送體系 5007.4.4 藥物封裝型DNA納米遞送體系 5057.4.5 總結與展望 509參考文獻 5097.5 DNA自組裝與納米光子學 5157.5.1 引言 5157.5.2 DNA自組裝表面等離子體納米結構的制備 5167.5.3 DNA自組裝納米光子學結構的雜化理論 5207.5.4 DNA結構指導表面等離子體納米結構手性調控 5237.5.5 DNA結構指導表面增強拉曼散射研究 5287.5.6 DNA結構指導增強熒光研究 5307.5.7 總結與展望 532參考文獻 533第8章 核酸分子機器與計算機 5408.1 從DNA自組裝到DNA分子機器 5408.1.1 DNA納米結構 5408.1.2 DNA等溫復制機器 5468.1.3 金屬離子依賴型核酸酶實現DNA邏輯計算 5508.1.4 總結與展望 551參考文獻 5528.2 DNA分子機器從運動到功能 5548.2.1 基于鏈置換反應的DNA分子機器 5548.2.2 基于環境因素改變的DNA分子機器 5608.2.3 DNA分子機器的功能化表現 5648.2.4 總結與展望 568參考文獻 5688.3 會玩游戲的DNA計算機 5738.3.1 從脫氧核酶邏輯門到可編程的自動裝置 5748.3.2 可以玩游戲的DNAMAYA自動裝置 5758.3.3 DNA計算機領域相關的研究進展 5818.3.4 DNA計算機領域未來展望 583參考文獻 5848.4 基于分子電路的DNA計算 5858.4.1 引言 5858.4.2 基于鏈置換級聯效應的DNA電路 5868.4.3 基于鏈置換催化反應的DNA電路 5888