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本書系統全面地闡述微生物生態學的基本原理、研究現狀、微生物在地球化學循環中的作用；歸納環境微生物生態學的研究方法；解析活性污泥、飲用水管道、好氧反硝化脫氮微生物和景觀水體微生物生態特征，并結合案例分析環境微生物生態學理論在高效菌群/菌株分離中的應用；介紹環境微生物生態學中針對高通量測序數據的多種高級統計分析方法和可視化技術。