醫學生物學進入21世紀后，首先是醫學生物學測量系統化的轉變，以基因組為先導的一系列"組"(基因組、蛋白質組、代謝組等)項目的開展、特別是高通量實驗技術的發展，使得醫學生物學領域內的數據急劇膨脹，而既往的以單一因素為研究重點的研究方法，已經不能適應基于系統測量產生的數據增長速度。這就導致了領域內數據過多而知識和運用相對缺乏，將系統的觀念貫徹到科學實踐的每一個步驟--從數據測量、數據采集、數據儲存、數據分析到知識發現和實際運用的開發--系統的認識生命系統，在系統模型的指導下進行科學實踐，已經成為21世紀醫學生物學發展的必然趨勢。系統生物學也因此再一次興起，成為21世紀醫學生物學的熱點和發展方向。然而在憧憬系統生物學給我們帶來無限美好未來之前，我們應該了解到離真正的系統生物學的起飛還有一段距離，這包括了實驗技術、儀器設備、分析方法和數據資源構建等多方面軟硬件條件的成熟。
概論
Ⅰ：系統生物學基礎
1.系統生物醫學的基礎：導言
2.系統生物學中的基因組學技術
3.蛋白質組學技術
4.細胞調控網絡
5.MicroRNA與轉錄因子相互作用網絡
6.與整合素介導的黏附相關的蛋白質網絡
7.系統生物學和干細胞生物學
Ⅱ：系統生物學中的計算建模
8.系統生物學的發展對計算的挑戰
9.對生物系統的高層次建模
10.系統生物學中的系統分析
11.可視化細胞項目
12.系統生物學中的軟件工具
Ⅲ：系統生物學的應用
13.系統生物學中的生理組標記語言：模型的模塊化和重復利用
14.用于發育模式研究的系統化途徑
15.免疫建模在藥物開發中的應用
16.系統藥學用于癌癥研究
17.藥物開發中的系統生物學：利用預測生物醫學來指導新型抗癌藥物的研發
18.定量生物學在臨床實驗中的地位和作用
索引
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