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本著作從蛋白質互作網絡拓撲結構特性出發分析各種蛋白質加權網絡的特性，設計了有效地蛋白質相互作用預測算法，在這個預測后的蛋白質互作網絡的基礎上研究設計了蛋白質復合物和功能模塊識別算法。重點研究生物組學數據中的蛋白質作用組學數據，針對目前少有研究的蛋白質加權網絡，定義了新穎的網絡鏈路預測模型，提出了能有有效的預測蛋白質互作網絡鏈路預測算法。