主要涉及生物信息數據庫、序列比對、分子系統發育分析、基因組學與基因預測、蛋白質結構與功能預測、轉錄組與蛋白質組分析以及Perl語言在生物信息學中的應用等內容，力求使讀者全面了解和掌握生物信息學領域的重要基礎知識與基本操作技能。
前言
1 緒論
1.1 生物信息學的歷史
1.2 生物信息學的應用
1.3 生物信息學與其他學科的關系
2 生物數據庫介紹
2.1 序列數據庫
2.2 基因組數據庫
2.3 結構數據庫
2.4 功能數據庫
2.5 其他數據庫資源
3 序列比對
3.1 概述
3.2 序列比對的得分系統
3.3 兩條序列比對方法
3.4 多條序列比對方法
4 生物信息學常用概率統計學方法簡介
4.1 概述
4.2 序列對位顯著性檢驗
4.3 貝葉斯統計在序列對位中的應用
5 數據庫搜索
5.1 數據庫檢索
5.2 數據庫搜索相似序列
5.3 序列提交
6 分子系統發育分析
6.1 系統發育與系統發育樹
6.2 距離法
6.3 最大簡約法
6.4 極大似然法
7 基因組學與基因預測
7.1 引言
7.2 基因組測序技術及序列組裝
7.3 功能基因組學
7.4 比較基因組學
8 蛋白質結構與功能預測
8.1 蛋白質結構簡介
8.2 蛋白質三維結構分類及蛋白質家族
8.3 三維結構比對
8.4 蛋白質基本性質預測
8.5 蛋白質二級結構預測
8.6 蛋白質高級結構預測
8.7 蛋白質互作分析
8.8 藥物發現與設計
9 轉錄組與蛋白質組分析
9.1 轉錄組與基因芯片簡介
9.2 基因芯片數據采集與分析
9.3 蛋白質組簡介
9.4 雙向凝膠電泳數據分析
9.5 蛋白質質譜數據分析
10 Perl語言在生物信息學中的應用
10.1 Perl簡介
10.2 數據結構和程序控制
10.3 編寫生物信息學應用程序
10.4 BioPerl應用
新書資訊