本書是面向高等醫藥院校開展信息處理與分析教學活動設計的教材。本書以培養學生的信息獲取能力,分析與利用能力為目標,全面闡述了醫藥科研活動中所運用到的信息科學基本方法、技術,工具。全書共5章,主要包括信息處理與分析的內涵及相關技術,醫藥信息處理與分析的基本流程,醫藥信息分析質量保證的幾個關鍵因素,醫藥信息采集與預處理,醫藥信息分析方法和工具,醫藥信息處理與分析案例,醫藥信息標準。
(1)注重領域特色、組織結構合理
該書以醫藥信息為主線來組織素材,將信息處理技術與信息分析方法有機融合。全書采用總分式結構進行闡述:緒論中呈現了信息處理與分析的基本流程,使讀者從宏觀了解信息處理與分析每一步驟,進而激發讀者深入學習的興趣,以掌握信息處理與分析的每一階段的關鍵技術與方法;緊緊圍繞緒論,其它章節從內容上將信息處理與分析的每一環節有序貫通,使讀者在學習時對各章節的內容一目了然,并能有的放矢,達到事半功倍的學習效果。
(2)選材經典、注重理論與實踐的結合
本書的素材來自多年的教學積淀,選取了經典、有代表性的信息處理與分析的技術、工具與方法,列舉了大量的醫藥信息處理案例分析,同時每章還配有難度適當的練習,使得理論知識與實踐操作有機結合在一起,做到正真意義上的學以致用。
(3)引導思維、促進學科交叉
通過介紹醫藥信息處理技術以及信息分析方法和工具,使學生能夠從信息科學的角度對醫藥科學研究工作中的問題進行思考與分析,以解決跨學科間交流、合作帶來的鴻溝,從而促進多學科交叉合作的協同研究。
晏峻峰,湖南中醫藥大學博士、教授,長期從事中醫藥信息技術處理與分析的教學與科研工作,具有豐富的教學與實踐經驗,主編了多本信息技術教材。
第1章 緒論 1
1.1 信息的概念及相關知識 1
1.1.1 信息的概念 1
1.1.2 信息的基本特征 2
1.1.3 信息、數據與知識的關系 3
1.2 信息處理與分析的內涵及相關技術 4
1.2.1 信息處理的內涵 4
1.2.2 信息分析的內涵 5
1.2.3 信息論及相關常識 5
1.3 醫藥信息與醫藥信息學 7
1.3.1 醫藥信息 7
1.3.2 醫藥信息學 9
1.4 醫藥信息處理與分析的基本流程 9
1.5 醫藥信息分析質量保證的幾個關鍵因素 10
本章小結 12
本章習題 12
本章參考文獻 12
第2章 醫藥信息采集與預處理 13
2.1 醫藥信息資源的獲取與處理 13
2.1.1 文獻信息資源的獲取與處理 13
2.1.2 臨床信息資源的獲取與處理 40
2.1.3 實驗數據資源的獲取與處理 44
2.2 數據預處理的基本方法 45
2.2.1 數據清理 45
2.2.2 數據集成 46
2.2.3 數據變換 46
2.2.4 數據規約 47
2.3 醫藥信息管理及相關技術 47
2.3.1 文獻信息管理 48
2.3.2 數據管理 61
本章小結 62
本章習題 63
本章參考文獻 63
第3章 醫藥信息分析方法和工具 64
3.1 醫藥信息分析方法 64
3.1.1 醫藥信息分析的目的 65
3.1.2 醫藥信息分析內容的分類 65
3.1.3 醫藥信息分析方法的分類 65
3.1.4 構建分析體系的原則 66
3.2 常用信息分析工具 67
3.2.1 SAS統計軟件 67
3.2.2 SPSS統計軟件 67
3.2.3 MATLAB 68
3.2.4 R語言 68
3.2.5 Excel 68
3.3 MATLAB工具 69
3.3.1 MATLAB簡介 69
3.3.2 MATLAB的編程基礎 78
3.3.3 MATLAB的矩陣運算 82
3.3.4 MATLAB程序設計 90
3.3.5 MATLAB繪圖基礎 96
本章小結 107
本章附錄 常用MATLAB函數的使用方法 108
本章習題 115
本章參考文獻 116
第4章 醫藥信息處理與分析案例 118
4.1 多元線性回歸分析 118
4.1.1 多元線性回歸分析的基本思想 118
4.1.2 多元線性回歸分析的求解過程 119
4.1.3 多元線性回歸分析實例解析 120
4.2 主成分分析 122
4.2.1 主成分分析的基本思想 123
4.2.2 主成分分析的求解過程 123
4.2.3 主成分分析實例解析 126
4.3 聚類分析 128
4.3.1 聚類分析的基本思想 128
4.3.2 系統聚類 129
4.3.3 K-means聚類 133
4.4 判別分析 138
4.4.1 判別分析的基本思想 138
4.4.2 判別分析的求解過程 139
4.4.3 判別分析實例解析 140
4.5 決策樹分析 141
4.5.1 決策樹的基本概念 142
4.5.2 相關算法 143
4.5.3 決策樹的修剪 145
4.5.4 決策樹在醫院患者分析中的應用 147
4.6 支持向量機算法 150
4.6.1 基本思想 150
4.6.2 線性SVM的求解過程 153
4.6.3 其他類型的支持向量機 154
4.6.4 MATLAB的SVM函數使用 154
4.6.5 支持向量機算法實例解析 154
4.7 貝葉斯分類算法 155
4.7.1 基本思想 156
4.7.2 求解過程 157
4.7.3 實例解析 158
4.8 時間序列分析 159
4.8.1 原理 159
4.8.2 時間序列分析的實例分析 160
4.8.3 確定性時間序列分析案例 160
本章小結 165
本章函數詳細說明 166
本章習題 173
本章參考文獻 176
第5章 醫藥信息標準 177
5.1 常用醫藥信息標準介紹 177
5.1.1 標準的概念 177
5.1.2 標準化的概念 180
5.1.3 標準與標準化的關系 181
5.1.4 信息標準化 182
5.1.5 國際標準化機構和組織 182
5.1.6 醫學信息標準 183
5.1.7 醫學信息交換標準 184
5.2 醫學信息分類與編碼 186
5.2.1 分類 186
5.2.2 編碼 187
5.2.3 醫學信息分類與編碼的方法 187
5.3 醫藥信息處理與分析中應用標準的原則 188
本章小結 188
本章習題 188
本章參考文獻 189