本書(shū)是關(guān)于基因測(cè)序技術(shù)的一部綜合性著作。全面覆蓋了基因測(cè)序發(fā)展、RNA測(cè)序、DNA測(cè)序、基因組測(cè)序和拼接以及基因測(cè)序的應(yīng)用等。作為一本實(shí)驗(yàn)技術(shù)類(lèi)專(zhuān)著，本書(shū)不僅較詳細(xì)地闡述了有關(guān)技術(shù)的具體操作和程序，更著力于對(duì)各種技術(shù)的基本原理及其相關(guān)理論基礎(chǔ)進(jìn)行深層次的剖析。本書(shū)可以作為生命科學(xué)特別是分子生物學(xué)相關(guān)領(lǐng)域工作者的實(shí)驗(yàn)室必備參考工具書(shū)，同時(shí)也可供醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)等相關(guān)專(zhuān)業(yè)師生及科學(xué)工作者參考。
第一章 概述
第一節(jié) 基因測(cè)序的歷史
第二節(jié) 基因測(cè)序技術(shù)進(jìn)展
一、第一代基因測(cè)序技術(shù)
二、第二代基因測(cè)序技術(shù)
三、第三代基因測(cè)序技術(shù)
第三節(jié) 基因測(cè)序的應(yīng)用
參考文獻(xiàn)
第二章 雙脫氧測(cè)序法
第一節(jié) 雙脫氧鏈終止法的概念與原理
一、雙脫氧鏈終止法的概念
二、雙脫氧鏈終止法的原理
第二節(jié) 雙脫氧鏈終止法的操作步驟
一、變性雙鏈模板的制備
二、延伸和終止反應(yīng)
第一章 概述
第一節(jié) 基因測(cè)序的歷史
第二節(jié) 基因測(cè)序技術(shù)進(jìn)展
一、第一代基因測(cè)序技術(shù)
二、第二代基因測(cè)序技術(shù)
三、第三代基因測(cè)序技術(shù)
第三節(jié) 基因測(cè)序的應(yīng)用
參考文獻(xiàn)
第二章 雙脫氧測(cè)序法
第一節(jié) 雙脫氧鏈終止法的概念與原理
一、雙脫氧鏈終止法的概念
二、雙脫氧鏈終止法的原理
第二節(jié) 雙脫氧鏈終止法的操作步驟
一、變性雙鏈模板的制備
二、延伸和終止反應(yīng)
三、測(cè)序反應(yīng)物電泳和序列讀取
參考文獻(xiàn)
第三章 RNA測(cè)序
第一節(jié) 轉(zhuǎn)錄組概念及研究意義
一、轉(zhuǎn)錄組概念
二、轉(zhuǎn)錄組研究的意義
第二節(jié) RNA測(cè)序技術(shù)方法
一、表達(dá)序列標(biāo)簽技術(shù)
二、表達(dá)系列分析技術(shù)
三、新一代高通量測(cè)序技術(shù)（RNAseq）
四、單分子測(cè)序技術(shù)
小結(jié)
參考文獻(xiàn)
第四章 合成法DNA測(cè)序的集成系統(tǒng)
第一節(jié) Roche/454 FLX測(cè)序的基本原理及操作流程
一、背景介紹
二、454測(cè)序法的原理
三、454生命科學(xué)皮升級(jí)測(cè)序系統(tǒng)流程
四、應(yīng)用前景
第二節(jié) Illumina/Solexa Genome Analyzer測(cè)序的基本原理及操作流程
一、Illumina/Solexa Genome Analyzer測(cè)序的基本原理
二、Illumina/Solexa Genome Analyzer測(cè)序的操作流程
三、Illumina/Solexa Genome Analyzer測(cè)序的技術(shù)優(yōu)勢(shì)
四、Illumina/Solexa Genome Analyzer測(cè)序的應(yīng)用
第三節(jié) Applied Biosystems SOLiD system
一、Applied Biosystems SOLiD system測(cè)序的基本原理
二、Applied Biosystems SOLiD system測(cè)序的操作流程
三、Applied Biosystems SOLiD system測(cè)序的技術(shù)優(yōu)勢(shì)
四、Applied Biosystems SOLiD system測(cè)序的應(yīng)用
小結(jié)
參考文獻(xiàn)
第五章 全基因組水平的單分子測(cè)序
第一節(jié) 單分子測(cè)序簡(jiǎn)介
一 、單分子測(cè)序技術(shù)的出現(xiàn)
二、單分子測(cè)序技術(shù)的分類(lèi)
第二節(jié) Heliscope單分子測(cè)序技術(shù)
一、基本原理
二、tSMS技術(shù)流程
三、Heliscope單分子測(cè)序技術(shù)的特點(diǎn)
第三節(jié) 單分子實(shí)時(shí)技術(shù)
一、基本原理
二、smrt技術(shù)流程
第四節(jié) 納米孔單分子技術(shù)
一、基本原理
二、納米孔測(cè)序技術(shù)的特點(diǎn)
三、納米孔測(cè)序技術(shù)要面臨的挑戰(zhàn)
小結(jié)
一、三代測(cè)序技術(shù)的對(duì)比
二、單分子測(cè)序技術(shù)的應(yīng)用
參考文獻(xiàn)
第六章 基因組測(cè)序與拼接
第一節(jié) 序列拼接簡(jiǎn)介
第二節(jié) 序列拼接
一、常用算法
二、常用拼接軟件
第三節(jié) 基因組組裝
一、組裝策略
二、常見(jiàn)問(wèn)題
三、組裝結(jié)果檢驗(yàn)
四、組裝后生物信息學(xué)分析
第四節(jié) 新基因發(fā)現(xiàn)
一、基因簡(jiǎn)介
二、基因組挖掘
三、發(fā)現(xiàn)基因的一般過(guò)程
第五節(jié) 基因組注釋
小結(jié)
參考文獻(xiàn)
第七章 基因測(cè)序的應(yīng)用
第一節(jié) 基因組研究
一、 PCR克隆測(cè)序驗(yàn)證
二、突變體檢測(cè)
三、新基因組檢測(cè)
四、全基因組檢測(cè)
五、系統(tǒng)發(fā)育及物種鑒定
第二節(jié) 臨床研究
一、個(gè)體識(shí)別——親緣鑒定
二、 SNP關(guān)聯(lián)分析
三、臨床疾病診斷應(yīng)用
第三節(jié) 食品安全檢測(cè)
一、常規(guī)微生物檢測(cè)
二、突發(fā)食品事件檢測(cè)
三、轉(zhuǎn)基因食品檢測(cè)
小結(jié)
參考文獻(xiàn)
第八章 表觀遺傳測(cè)序
第一節(jié) 甲基化測(cè)序
一、DNA甲基化概述
二、 DNA甲基化測(cè)序方法
第二節(jié) ChIP測(cè)序
參考文獻(xiàn)
第九章 基因組圖譜
第一節(jié) 人類(lèi)基因組計(jì)劃
一、中美英聯(lián)合啟動(dòng)“千人基因組計(jì)劃”
二、 “炎黃計(jì)劃”
三、 韓國(guó)人基因組圖譜
四、日本人基因組圖譜
第二節(jié) 癌癥及其他疾病的基因組圖譜
一、癌癥基因組圖譜分析
二、 其他疾病基因組圖譜分析
第三節(jié) 經(jīng)濟(jì)作物基因測(cè)序圖譜
一、 小麥基因組圖譜
二、木瓜基因組圖譜
三、大豆基因組圖譜
四、馬鈴薯基因組圖譜
五、玉米基因組圖譜
六、草莓基因組圖譜
七、可可樹(shù)基因組圖譜
八、高粱基因組圖譜
第四節(jié) 模式生物基因測(cè)序圖譜
一、 猩猩基因組圖譜
二、 大熊貓基因組圖譜
三、瘧原蟲(chóng)基因組圖譜
四、 霉菌基因組圖譜
五、擬南芥基因組圖譜
六、水稻基因組圖譜
七、果蠅基因組圖譜
第五節(jié) 其他生物基因組測(cè)序
一、中國(guó)人參基因組圖譜
二、鴨嘴獸基因組圖譜
參考文獻(xiàn)
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