本書由16所985、211高校聯(lián)合編寫而成，系統(tǒng)全面地介紹了生物信息學(xué)的基本概念與內(nèi)容。全書共12章，內(nèi)容涵蓋分子生物學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)、DNA/氨基酸序列比對(duì)、基因結(jié)構(gòu)與功能、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能、系統(tǒng)生物學(xué)、合成生物學(xué)、計(jì)算生物學(xué)等生物信息學(xué)中的重點(diǎn)問(wèn)題。第一章回顧了生物信息學(xué)歷史，第二章介紹了分子生物學(xué)相關(guān)信息資源，第三章至第六章敘述了從序列比對(duì)分析到蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)再到基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)的研究，第七章和第八章介紹了系統(tǒng)生物學(xué)與合成生物學(xué)的研究?jī)?nèi)容及成果，第九章介紹了分子進(jìn)化分析方法，第十章討論了統(tǒng)計(jì)學(xué)習(xí)與推理等基本知識(shí)，第十一章討論了生物信息學(xué)基本的編程基礎(chǔ)，第十二章敘述了第二代測(cè)序技術(shù)的基本概念與分析應(yīng)用。
本書可用作高等院校生物信息學(xué)專業(yè)的教材，也可作為科研院所相關(guān)專業(yè)學(xué)生、研究人員的參考用書。
彩版
序
前言
第一章 生物信息學(xué)的概念及其發(fā)展歷史
第一節(jié) 生物信息學(xué)的發(fā)展歷史
第二節(jié) 生物信息學(xué)的研究領(lǐng)域
第三節(jié) 生物信息學(xué)的主要應(yīng)用
第四節(jié) 生物信息學(xué)面臨的挑戰(zhàn)
思考題
參考文獻(xiàn)
第二章 生物學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)及其檢索
第一節(jié) 生物學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)簡(jiǎn)介
第二節(jié) 生物學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的內(nèi)容與結(jié)構(gòu)
第三節(jié) 生物學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的檢索
思考題
參考文獻(xiàn)
第三章 序列比對(duì)原理
第一節(jié) 序列比對(duì)相關(guān)概念
第二節(jié) 序列比對(duì)打分方法
第三節(jié) 序列比對(duì)算法
第四節(jié) 序列比對(duì)工具
第五節(jié) 多序列比對(duì)
思考題
參考文獻(xiàn)
第四章 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析
第一節(jié) 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)組織層次
第二節(jié) 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的測(cè)定與理論預(yù)測(cè)
第三節(jié) 蛋白質(zhì)折疊與疾病
思考題
參考文獻(xiàn)
第五章 真核生物基因組的注釋
第一節(jié) 蛋白質(zhì)編碼基因的注釋
第二節(jié) RNA基因的注釋
第三節(jié) 重復(fù)序列的注釋
第四節(jié) 假基因的注釋
第五節(jié) 案例分析:黃瓜基因組的注釋
思考題
參考文獻(xiàn)
第六章 蛋白質(zhì)組學(xué)
第一節(jié) 蛋白質(zhì)組學(xué)概述
第二節(jié) 蛋白質(zhì)的大規(guī)模分離鑒定技術(shù)
第三節(jié) 蛋白質(zhì)的翻譯后修飾
第四節(jié) 蛋白質(zhì)分選
第五節(jié) 蛋白質(zhì)相互作用
思考題
參考文獻(xiàn)
第七章 系統(tǒng)生物學(xué)
第一節(jié) 系統(tǒng)生物學(xué)基本概念
第二節(jié) 系統(tǒng)生物學(xué)基本技術(shù)與方法
第三節(jié) 先進(jìn)的成像技術(shù)
第四節(jié) 基因表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)
第五節(jié) 代謝網(wǎng)絡(luò)
第六節(jié) 信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑
第七節(jié) 蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)
第八節(jié) 虛擬細(xì)胞
思考題
參考文獻(xiàn)
第八章 合成生物學(xué)
第一節(jié) 合成生物學(xué)概述
第二節(jié) 合成生物學(xué)基礎(chǔ)研究經(jīng)典實(shí)例
第三節(jié) 合成生物學(xué)應(yīng)用研究經(jīng)典實(shí)例
思考題
參考文獻(xiàn)
第九章 分子進(jìn)化與系統(tǒng)發(fā)育
第一節(jié) 分子進(jìn)化與系統(tǒng)發(fā)育
第二節(jié) 分子系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建方法
第三節(jié) 系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建及應(yīng)用
思考題
參考文獻(xiàn)
第十章 統(tǒng)計(jì)學(xué)習(xí)與推理
第一節(jié) 統(tǒng)計(jì)學(xué)習(xí)與推理基礎(chǔ)
第二節(jié) 統(tǒng)計(jì)模型與參數(shù)推斷
第三節(jié) 聚類分析、主成分分析與Fisher判別
第四節(jié) 貝葉斯推理
第五節(jié) 隱馬爾可夫模型
第六節(jié) 動(dòng)態(tài)神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)
第七節(jié) 支持向量機(jī)
第八節(jié) MATLAB的應(yīng)用實(shí)例
思考題
參考文獻(xiàn)
第十一章 生物信息學(xué)編程基礎(chǔ)
第一節(jié) Linux操作系統(tǒng)
第二節(jié) 生物信息學(xué)中的編程語(yǔ)言
第三節(jié) SQL及數(shù)據(jù)庫(kù)編程
第四節(jié) 并行計(jì)算
思考題
參考文獻(xiàn)
第十二章 第二代測(cè)序技術(shù)及其應(yīng)用
第一節(jié) 測(cè)序技術(shù)概述
第二節(jié) 第二代測(cè)序原理
第三節(jié) 第二代測(cè)序技術(shù)的應(yīng)用
第四節(jié) 生物信息學(xué)在第二代測(cè)序中的應(yīng)用
思考題
參考文獻(xiàn)
作者介紹
陳銘、何華勤、徐程
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