《常用生物統計學與生物信息學軟件實用教程》以生命科學研究的一般規律為主線,以生物統計學與生物信息學軟件為主,深入淺出地介紹生命科學研究中常用的軟件,以便學生在本科階段初步掌握生物統計學與生物信息學相關的軟件操作。其包括統計類軟件如正交設計助手、Excel、Origin、SPSS、Minitab 和DPS,生物信息學軟件和工具如NCBI、DNA 序列比對和系統發育樹的構建、引物設計、DNAMAN 軟件,以及科技寫作相關的軟件和工具等。
第一篇 生物統計類軟件
第一章 正交設計助手
第二章 響應面設計軟件Design Expert
1.安裝
2.PB 設計
3.BBD
第三章 電子表格軟件Excel
1.圖表的制作
2.分析工具庫的加載
3.數據資料的整理與描述
4.兩平均數的差異顯著性檢驗
5.方差分析
6.回歸與相關分析
第四章 科學作圖軟件Origin
1.安裝
2.對幾組數據進行自動運算
3.作柱狀、條狀或折線圖,加誤差線
4.多坐標軸圖
5.多屏圖
6.紅外光譜作圖
7.直線回歸
第五章 統計學軟件SPSS
1.t 檢驗
2.方差分析
3.作圖
4.直線回歸
5.正交表的生成
第六章 統計學軟件Minitab
1.數據操作
常用生物統計學與生物信息學軟件實用教程
2.常用圖形的操作
3.t 檢驗
4.響應面設計
第七章 數據處理系統DPS
1.兩個樣本平均數的差異顯著性檢驗
2.方差分析
3.卡方檢驗
4.回歸分析與相關分析
第二篇 常用生物信息學軟件和工具
第八章 NCBI 數據庫的利用
1.進入NCBI 主頁
2.使用Entrez 搜索
3.利用BankIt 向GenBank 數據庫在線提交序列
第九章 DNA 序列比對和系統發育樹的構建
第十章 實時定量PCR 目的基因保守區的查找
1.背景知識
2.操作舉例
3.思考
第十一章 引物設計軟件Primer Premier
第十二章 多用生物信息學軟件DNAMAN
1.向DNAMAN 中導入序列
2.序列比對分析
3.序列同源性分析
4.PCR 引物設計
5.限制性酶切位點分析
6.繪制質粒模式圖
7.蛋白質分析
第三篇 其他科研軟件和工具
第十三章 文獻檢索
1.中英文文獻檢索
2.專利文獻檢索
3.免費網絡資源
第十四章 科技寫作相關軟件
1.Word 中與科技寫作相關的操作
2.文獻管理軟件EndNote
3.文本整理器
參考文獻
附錄
附錄1 實用軟件下載方法
1.圖書館主頁
2.利用網絡引擎
3.360 軟件管家
4.專業下載網站
5.文檔共享網站
6.論壇相關版塊
附錄2 實用小軟件
1.PDF 合并
2.PDFMate PDF Converter
3.備忘軟件和工具
4.分子質量計算器
5.抽簽軟件
6.專業詞典
附錄3 生物統計學及生物信息學軟件參考大綱
附錄4 期末考核參考題目
附錄5 本科畢業論文問題
1.論文提綱
2.參考文獻
3.英文字母和數字格式
4.標題編號
5.結果部分
6.討論部分