本書的研究內容主要包括三個方面：一是跨域合作治理中府際關系的理論構建，運用制度性集體行動框架和交易成本理論，構建了一個跨域合作治理機制選擇的理論分析框架，以此來分析制約政府縱向協作和橫向協作之間關系的影響因素。二是對我國跨域合作治理中的府際關系進行分析，指出了我國當前跨域合作治理機制的特征及趨勢，從三個層面對我國跨域合作治理機制中的府際關系進行剖析，提出了縱向嵌入式機制的概念，并結合我國府際關系的特征，構建了縱向嵌入式治理機制選擇的分析框架。三是從城市群治理、流域生態補償、流域水資源綜合治理、區域大氣污染治理等方面對我國跨域合作治理中的府際關系進行了實證研究。
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