《普通高等教育“十一五”規劃教材：生物化學》在介紹了生物化學的發展及生命的化學基礎等基本概況的基礎上，在分子水平從三大方面闡述了生物化學的內容：①生命的分子基礎，包括蛋白質、核酸、酶、維生素與輔因子、生物膜。②生物的氧化和代謝，包括生物氧化、糖類代謝、脂類代謝、氨基酸與核苷酸代謝。③生命的遺傳信息流動，包括復制、轉錄、反轉錄、翻譯和代謝調節。同時，就有關應用也做了闡述。
前言
緒論
第一節 生物化學的含義
第二節 生物化學的發展
第三節 生物的化學特征
一、元素特征
二、非共價鍵的作用
三、基本的分子組成
四、生物大分子的組成
五、生物體的結構層次性
第四節 生物化學與其他學科的關系
第五節 生物化學的應用和發展前景
第一部分 生命的分子基礎
第一節 蛋白質
一、蛋白質的元素組成
二、蛋白質的分類
三、蛋白質的生物功能
第二節 氨基酸
一、氨基酸的結構特點與分類
二、氨基酸的重要性質
三、氨基酸的分離分析
第三節 肽
一、肽與肽鍵
二、天然存在的活性寡肽
第四節 蛋白質的分子結構
一、蛋白質的一級結構
二、蛋白質的二級結構
三、超二級結構和結構成
四、蛋白質的三級結構
五、蛋白質的四級結構
六、纖維狀蛋白質
第五節 蛋白質結構與功能的關系
一、蛋白質一級結構與功能的關系
二、蛋白質的高級結構與功能的關系
第六節 蛋白質的理化性質
一、蛋白質的兩性電離及等電點
二、蛋白質的膠體性質
三、蛋白質的沉淀
四、蛋白質的變性
五、蛋白質的顏色反應
六、紫外吸收
第七節 蛋白質的分離、純化與鑒定
一、蛋白質的分離、純化的一般程序
二、蛋白質的分離純化的一般方法
三、蛋白質含量的測定與純度鑒定
四、蛋白質分子量的測定方法
第二章 核酸化學
第一節 核酸的種類、分布與功能
一、核酸的種類與分布
二、核酸的生物學功能
三、核酸的化學組成
四、細胞內的其他核苷酸及其衍生物
第二節 核酸的分子結構
一、多核苷酸鏈
二、DNA的分子結構
三、RNA的分子結構
第三節 核酸與蛋白質的復合體——核蛋白體
一、病毒
二、真核染色體
第四節 核酸的理化性質
一、核酸的一般性質
二、核酸的紫外吸收特性
三、核酸的變性和復性
四、分子雜交
五、核酸的沉降特性
第五節 核酸的分離純化及含量測定
一、DNA的分離純化
二、RNA的分離純化
三、核酸的純化
四、核酸含量的測定
第三章 酶
第一節 酶的概述
……
第四章 維生素與輔因子
第五章 生物膜
第二部分 生物的氧化和代謝
第六章 生物氧化
第七章 糖類代謝
第八章 脂類代謝
第九章 蛋白質酶促降解和氨基酸代謝
第十章 核酸酶促降解和核苷酸代謝
第三部分 生命的遺傳信息流動
第十一章 核酸的生物合成
第十二章 蛋白質的生物合成
第十三章 代謝調節
主要參考文獻
三、蛋白質的分泌途徑與方式
分泌蛋白、溶酶體蛋白和某些膜蛋白按照內質網一高爾基體一質膜轉運途徑進行。其特點是：①由胞質游離核糖體合成的蛋白質在N端有一額外的肽段，含有15～30個疏水性氨基酸殘基。但在成熟的分泌蛋白中并不存在，這段額外的序列被稱為信號肽。其主要的功能是引導隨后的新生肽穿過內質網膜進入腔內，并指導多肽鏈（或蛋白質）進到應到達的目的地。②采取邊合成邊轉運（或插入）的機制進行的，它將新生肽鏈運送到粗面內質網腔內。③進入內質網（ER）腔內的蛋白質進行糖基化修飾或其他方式的修飾。對于欲進入亞細胞的蛋白質還需跨膜轉運才能到位。當它們從。ER運送到高爾基體時，還需進一步糖基化修飾以利于形成最佳的構象。④蛋白質折疊成特定的有活性的構象。⑤通過轉運到達溶酶體或分泌性囊泡和質膜中去，或分泌到胞外。
（一）分泌蛋白的合成機制——邊翻譯邊轉運
1975年，Blobel和Dobbestein提出分泌蛋白穿越內質網膜的信號肽假說。Blobel等證明，識別信號肽的是一種核蛋白體，稱為信號識別體（SRP）。由于SRP、SRP受體等蛋白因子的發現，豐富了原來的假說。該假說認為，分泌蛋白、膜蛋白mRNA首先與游離的核糖體（包括大小亞基）形成翻譯起始復合物，mRNA的翻譯即從起始密碼子AUG開始，合成出疏水殘基的信號肽。當翻譯50～70個氨基酸殘基時，核糖體上的轉位酶驅使信號肽從核糖體延伸出來，隨即胞質中的信號肽識別蛋白識別信號肽并與之結合，導致肽鏈的延伸暫停。其原因是SRP這個大復合物的相對分子質量為396 000，有兩個功能域，一個用以識別信號肽，另一個用以干擾進入的氨酰-tRNA和肽酰移位酶的反應，以終止多肽鏈的延伸作用，信號肽與SRP的結合發生在蛋白質合成剛一開始時，即N端的新生肽鏈剛一出現時，一旦SRP與帶有新生肽鏈的核糖體相結合，肽鏈的延伸作用暫時終止，或延伸速度大大減低。此時[SRP-mRNA-核糖體-新生肽]復合物轉向內質網膜并與膜上的SRP受體停泊蛋白相結合并相互作用，肽鏈延伸又重新開始，SRP受體是一個二聚體蛋白，由相對分子質量為69 000的a亞基與相對分子質量為30 000的13亞基組成。然后帶有新生肽鏈的核糖體被送人多肽移位裝置，同時SRP被釋放到胞漿中，進入SRP循環再去識別另一個信號肽。此時蛋白質合成修復，肽鏈得以延伸。移位裝置含兩個膜整合蛋白：ribophorinI和Ⅱ，它們能將新生肽鏈構象改變以線形形式穿過內質網膜進入腔內，信號肽被信號肽酶切割。綜上可知，分泌蛋白的合成是邊翻譯邊轉運的，整個過程總結于圖12-11。
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